dos shp que no coinciden

Buenas tardes

Tengo dos shp de una provincia en Ecuador, uno es el límite político - administrativo y la otra es de ríos. Cuando cargo ambos shp en un mismo layer no me coinciden en espacio y es evidente que el shp de ríos tiene problemas en la proyección. Ya lo he proyectado y nada. he llevado ambas capas a un mismo sistema y nada. Me pudiera ayudar. Gracias